09/08: François Affolter ist U-18 Nationalspieler für die Schweiz.

02/2009: François Affolter ist U-19 Nationalspieler für die Schweiz.

20.07.09: François Affolter nimmt für die Schweiz an der U-19 Europameisterschaft 2009 (Under 19 European Championship) in der Ukraine teil.

08/2009: François Affolter ist U-21 Nationalspieler für die Schweiz.

08/2010: François Affolter ist A-Nationalspieler für die Schweiz.

06/2011: François Affolter nimmt für die Schweiz an der U-21 Europameisterschaft 2011 (UEFA European Under-21 Football Championship) in Dänemark teil. 

24.01.12: Der schweizer U21 Nationalspieler und Innenverteidiger Francois Affolter (20) wechselt auf Leihbasi mit Kaufoption von Young Boys Bern zu Werder Bremen.

07/2012: François Affolter nimmt mit der U23 von der Schweiz an den Olympischen Spielen in London teil.